1963年，在修復莫斯科克里姆林宮的阿爾罕格爾斯克大教堂時，人們打開了伊凡雷帝及其他一些人的陵墓，對雷帝的遺骸進行了部分化學分析。分析結果表明：有大量的水銀分子存在。根據法醫的意見：不能完全排除用藥物一下子或是緩慢地毒殺他的可能性。據此，一位研究伊凡雷帝的專家首次對傳統看法提出異議，他認為沙皇是被人謀殺的。

　　而最近新的說法不斷出爐，例如，“伊凡四世比人們預料的死得早”、“一個受到雷帝寵信的顯貴別依斯基給了他一份醫生配制的飲料，里面放了毒藥”。一時之間，人們的注意力集中到“宮廷謀殺”上。

　　根據史料分析，波·戈杜諾夫的嫌疑最大，因為他對沙皇早已懷恨在心。伊凡雷帝在年過半百、身患疾病之時，還正式向英國女王伊麗莎白

　　一世的侄女求婚，這對身為貴族的戈杜諾夫及其親屬構成嚴重威脅。一旦伊凡四世和英國王室聯姻，將對太妃戈杜諾娃·伊琳娜的丈夫——王儲伊凡諾維奇極其不利。據說，有一次，暴怒的沙皇不知為了什么事情要嚴懲王儲，戈杜諾夫想替王儲求情，沒想到也被伊凡雷帝一同痛打，致使戈杜諾夫在家躺了好多天不能到王宮去。而伊凡雷帝不僅對此事不感懊悔，反而對王儲有了猜疑。此外，伊凡雷帝還對伊琳娜有過非分之舉，也使戈杜諾夫對伊凡雷帝產生了仇恨心理。

　　而另外一位嫌疑人則是別伊斯基。據說，伊凡雷帝晚年時非常害怕在沒有懺悔、沒有領受圣餐禮的情況下突然撒手人寰。于是他從全國各地召來60名巫師和巫醫，由衛隊嚴加看管。每天，他派別伊斯基去了解這些人的占卜和預告，并向自己匯報。據說女巫們曾對別伊斯基講過，天上最強有力的星宿都反對沙皇，她們甚至預言了沙皇死亡的日期。別伊斯基隱瞞了實情，然而伊凡雷帝不知道從哪里知道了預言，他情緒失控，暴跳如雷地大喊，要在預言他死亡的那一天，把那些巫師全部燒死，還要把隱瞞者別伊斯基斬首。別伊斯基等于是被伊凡雷帝逼上了絕路，于是，他和戈杜諾夫一起殺死了伊凡雷帝。